Virus

From Wikispecies
Jump to: navigation, search

Taxonavigation

Regnum: Virus
Phylum: not divided
Classis: not divided
Ordines: Caudovirales – Herpesvirales – Ligamenvirales – Megavirales (tentative) – Mononegavirales – Nidovirales – Picornavirales – Tymovirales

Unassigned Familiae: Adenoviridae – Alphatetraviridae – Alvernaviridae – Amalgaviridae – Ampullaviridae – Anelloviridae – Arenaviridae – Ascoviridae – Asfarviridae – Astroviridae – Avsunviroidae – Baculoviridae – Barnaviridae – Benyviridae – Bicaudaviridae – Bidnaviridae – Birnaviridae – Bromoviridae – Bunyaviridae – Caliciviridae – Carmotetraviridae – Caulimoviridae – Chrysoviridae – Circoviridae – Clavaviridae – Closteroviridae – Corticoviridae – Cystoviridae – Endornaviridae – Flaviviridae – Fuselloviridae – Geminiviridae – Globuloviridae – Guttaviridae – Hepadnaviridae – Hepeviridae – Hypoviridae – Hytrosaviridae – Inoviridae – Iridoviridae – Leviviridae – Luteoviridae – Marseilleviridae – Megabirnaviridae – Megaviridae – Metaviridae – Microviridae – Mimiviridae – Mycodnaviridae – Nanoviridae – Narnaviridae – Nimaviridae – Nodaviridae – Nudiviridae – Ophioviridae – Orthomyxoviridae – Papillomaviridae – Partitiviridae – Parvoviridae – Permutotetraviridae – Phycodnaviridae – Picobirnaviridae – Plasmaviridae – Pleolipoviridae – Polydnaviridae – Polyomaviridae – Pospiviroidae – Potyviridae – Poxviridae – Pseudoviridae – Quadriviridae – Reoviridae – Retroviridae – Sphaerolipoviridae – Spiraviridae – Tectiviridae – Togaviridae – Tombusviridae – Totiviridae – Turriviridae – Virgaviridae

Unassigned Genera: Bacilladnavirus – Cilevirus – Deltavirus – Dinodnavirus – Emaravirus – Higrevirus – Idaeovirus – Mollivirus – Ourmiavirus – Pandoravirus – Pithovirus – Polemovirus – Rhizidiovirus – Salterprovirus – Sobemovirus – Tenuivirus – Varicosavirus

Unassigned Species: Abalone shriveling syndrome-associated virus – Bandicoot papillomatosis carcinomatosis virus – Chronic bee paralysis virus – Hawaiian rubus leaf curl virus – KIs virus – Orchid fleck virus – Sea turtle tornovirus 1


Baltimore classification: Group I: dsDNA – Group II: ssDNA – Group III: dsRNA – Group IV: ssRNA(+) – Group V: ssRNA(-) – Group VI: ssRNA(RT) – Group VII: dsDNA(RT)


Subviral agents (King et al. 2011): Satellites and other virus-dependent nucleic acids – Viroids – Prions

Name

  • Aphanobionta Novak, 1930, Rothmaler, 1951
  • Archaeophyta Barkley, 1939 non Archephyta Haeckel, 1866
  • Vira Holmes, 1939
  • Viriphyta McKinney, 1944
  • Virales Holmes, 1948
  • Archetista Jahn & Jahn, 1949
  • Vireae Barkley, 1949
  • Acellularae Traub, 1963
  • Protobiota Hsen-Hsu, 1965
  • Vira Barkley, 1970
  • Acytota Jeffrey, 1971
  • Akamara Hurst, 2000

Alternative classifications

Holmes in Breed et al. (1948)

Holmes, F.O. 1948. Order Virales: the filterable viruses. In: Breed, R.S., Murray, E.G.D. & Hitchens, A.P. (eds). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, 6th ed. The Williams and Wilkins Co., Baltimore, Bergey's manual of determinative bacteriology, The Outline Classification used in The Bergey Manual of Determinative Bacteriology.

Division Schizophyta

Barkley (1949)

Barkley, Fred A. Un esbozo de clasificación de los organismos. Revista de la Facultad Nacional de Agronomia, Universidad de Antioquia, Medellín. 10: 83–103, (PDF) (Spanish)

  • Mychota (Monera, Anucleobionta)
    • Schizophyta
      • Schizomycophyta (Myxothallophyta)
        • Vireae (Viriphyta)
          • Bacteriophagales (Zoophagi, Phytophagi)
          • Rickettsiales
        • Schyzomycetes (Eubacteriae)
        • Spirochaetae
      • Cyanophyta
  • Protista
  • Euplanta
  • Euanimalia

Rothmaler (1951)

Rothmaler, Werner. 1951. Die Abteilungen und Klassen der Pflanzen. Feddes Rep Spec Nov Reg Veg 3: 256–266, Google Books, Abstract.

Lwoff, Horne & Tournier (1962)

Lwoff, A., Horne, R. & Tournier, P. 1962. A system of viruses. Cold Spring Harb Symp Quant Biol., 27, 51–55.

Key characteristics for classification:

  • Nucleic acid (RNA or DNA): R or D
    • Capsid symmetry (helical, cubical or dual): H, C or B
      • Presence of a lipid envelope (naked or enveloped): N or E
        • Diameter of capsid, or number of capsomers

Hsen-Hsu (1965)

Hsen-Hsu, Hu. 1965. The major groups of living beings: a new classification. Taxon 14(8): 254–261.

  • Protobiota [including Rickettsiae, viruses and bacteriophages]
  • Cytobiota
    • Bacteriobionta
    • Myxobionta
    • Mycobionta
    • Phytobionta
    • Zoobionta

Baltimore (1971)

Baltimore, D. 1971. Expression of animal virus genomes. Bacteriological Reviews, 35(3), 235, Abstract and PDF

  • Group I: Double-stranded DNA viruses (dsDNA)
  • Group II: Single-stranded DNA viruses (ssDNA)
  • Group III: Double-stranded RNA viruses (dsRNA)
  • Group IV: Single-stranded RNA viruses whose mRNA is identical in base sequence to virion RNA (+ssRNA)
  • Group V: Single-stranded RNA viruses whose genome is complementary in base sequence to the mRNA (-ssRNA)
  • Group VI: Single-stranded RNA viruses that replicate through a DNA intermediate (ssRNA-RT)
  • Group VII: Double-stranded DNA viruses that replicate through a single-stranded RNA intermediate (dsDNA-RT)

Hurst (2000)

Christon J. Hurst 2011. An Introduction to Viral Taxonomy with Emphasis on Animal Hosts and the Proposal of Akamara, a Potential Domain for the Genomic Acellular Agents. Studies in Viral Ecology: Animal Host Systems, Volume 2. doi: 10.1002/9781118025710.ch2

  • Dominio: Akamara
    • Reino: Euviria
      • Virus
      • Virus satélite
    • Reino: Viroida
      • Viroide
      • Virusoide

King et al. (2011)

King, A. M. Q., Adams, M. J., Carstens, E. B. & Lefkowitz, E. J. (eds). 2011. Virus taxonomy: 9h report of the International Committee on the Taxonomy of Viruses. Elsevier Academic Press, San Diego, Google Books. Partially disponible at: www.ictvonline.org

References

  • Gibbs, A. J. 2013. Viral taxonomy needs a spring clean; its exploration era is over. Virology Journal 10:254, (PDF).
  • Collier, Leslie, Balows, Albert & Sussman, Max 1998. Topley and Wilson's Microbiology and Microbial Infections ninth edition, Volume 1, Virology, volume editors: Mahy, Brian and Collier, Leslie. Arnold. ISBN 0340663162.
  • Dimmock, N.J., Easton, Andrew J. & Leppard, Keith 2007. Introduction to Modern Virology sixth edition, Blackwell Publishing, ISBN 1405136456.
  • Knipe, David M., Howley, Peter M., Griffin, Diane E., Lamb, Robert A., Martin, Malcolm A, Roizman, Bernard & Straus Stephen E. 2007. Fields Virology Lippincott Williams & Wilkins. ISBN 0781760607.
  • Shors, Teri 2008. Understanding Viruses. Jones and Bartlett Publishers. ISBN 0763729329.

Links

Vernacular names

Afrikaans: Virus
Alemannisch: Virus (pl. Vire)
العربية: فيروس
অসমীয়া: বিষাণু
asturianu: Virus
Avañe'ẽ: Popĩami
Bahasa Indonesia: Virus
Bahasa Melayu: Virus
বাংলা: ভাইরাস
Basa Sunda: Pirus
Boarisch: Viarus (pl. Viarusse, Viarn)
bosanski: Virus (pl. virusi)
български: Вирус
català: Virus
čeština: virus (pl. viry)
српски / srpski: вирус
Cymraeg: Feirws
dansk: Virus (pl. vira)
Deutsch: Virus (pl. Viren)
eesti: Viirus (pl. Viirused)
Ελληνικά: Ιός (pl. Ιοί)
English: Virus
español: Virus
Esperanto: Viruso
euskara: Birus
فارسی: ویروس
français: Virus
galego: Virus
ગુજરાતી: વિષાણુ
한국어: 바이러스
Hawaiʻi: Mea ho‘oma‘i
Հայերեն: Հարուցիչ
हिन्दी: विषाणु
hrvatski: Virus
interlingua: Virus
íslenska: Veira
italiano: Virus
עברית: נגיפים‏ / וירוסים
ქართული: ვირუსი
Latina: Virus
latviešu: Vīruss
lietuvių: Virusas
la .lojban.: vidru
magyar: Vírus
македонски: Вирус
मराठी: विषाणु
Nederlands: Virus
नेपाली: विषाणु
नेपाल भाषा: विषाणु
日本語: ウイルス
Nordfriisk: Wiiren
norsk bokmål: Virus
norsk nynorsk: Virus
occitan: Virús
ਪੰਜਾਬੀ: ਵਿਸ਼ਾਣੂ
پښتو: ويروس
ភាសាខ្មែរ: វិសាណូ, មេរោគ
polski: wirusy
português: Vírus
română: Virus
Runa Simi: Añaw
русский: Вирус
slovenčina: Vírus
slovenščina: Virus
suomi: Virus (pl. virukset)
svenska: Virus
ไทย: ไวรัส
Tiếng Việt: Virus, Siêu vi
Türkçe: Virüs
українська: Вірус
Volapük: Virud
ייִדיש: ווירוס
中文: 病毒
For more multimedia, look at Viruses on Wikimedia Commons.
Authority control