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La taxonomie est une branche changeante de la science. Le statut des différents noms publiés peut changer à la lumière de nouvelles connaissances. S'il s'avère que deux taxons, précédemment décrits et portant des noms différents, sont en fait identiques, le nom le plus ancien prévaut et le nouveau nom devient un "synonyme" du nom le plus ancien. Très souvent, les auteurs obtiennent de nouvelles informations qui suggèrent qu'une certaine espèce devrait appartenir à un genre différent de celui dans lequel elle a été décrite à l'origine. Lorsque l'espèce est associée à un nom générique différent, une "nouvelle combinaison" est formée. Les nouvelles combinaisons ne sont pas, à proprement parler, des "synonymes", mais elles sont souvent mentionnées avec les synonymes lorsqu'on présente l'histoire taxonomique d'un taxon. Si cette section contient à la fois des synonymes et différentes combinaisons, la rubrique peut être intitulée "Synonymie", car il s'agit d'un terme qui couvre l'histoire complète de tous les noms et combinaisons appliqués à un organisme. Les visiteurs étant susceptibles de rechercher les synonymes et les différentes combinaisons, il est essentiel que la synonymie soit présentée. Il est très utile de placer une liste de synonymes par date plutôt que par ordre alphabétique. En botanique, il est courant de diviser la synonymie en sous-groupes : basionyme (si cela est pertinent), homotypique et hétérotypique (chacun avec ses propres synonymes homotypiques), ce qui est également utile pour le visiteur.